Khatmil Qur'an di SD Islam Al Azhar 40 YPKS Cilegon tersebut merupakan prosesi puncak dari program wajib membaca Al-Qur'an yang selama ini dilakukan murid-murid setiap hari secara berkala. Program Khataman Al-Qur'an ini dimulai dari kelas 1 (satu) dan 2 (dua) yaitu Iqra 1 sampai 6, kemudian kelas 3 (tiga) sampai kelas 6 (enam) bertadarus Al-Qur'an sehingga di kelas 6 murid-murid sudah menyelesaikan juz 30.
Rasulullah SAW; " Ajarkanlah anak-anakmu 3 hal yaitu mencintai Nabi, Keluarganya, dan membaca Al-Qur'an", hal ini merupakan sesuatu yang harus kita syukuri bersama sebagai nikmat yang sangat besar dari Allah SWT.
Anugerah yang sangat berarti bagi murid-murid SD Islam Al Azhar 40 YPKS Cilegon adalah kekuatan untuk berfikir, kemampuan untuk memahami, dan kelincahan untuk bergerak, sehingga dapat menyelesaikan pendidikan di SD Islam Al Azhar 40 YPKS Cilegon dan dapat membaca, mengahafal, dan memahami ayat-ayat Al-Qur'an.
Dasar-dasar pendidikan di SD Islam 40 YPKS Cilegon, lebih khusus pengajaran Al-Qur'an, diharapkan:
Yaumul Qur'an atau khataman Al-Qur'an merupakan kegiatan yang menandai selesainya satu tahap pembelajaran Al-Qur'an penampilan prestasi anak dalam pembelajaran Al-Qur'an, sebagai implementasi KUM (Kuat aqidah, Unggul prestasi, mulia budi pekerti) sebagai wujud rasa syukur dan bahagia kami atas hasil yang telah dicapai oleh murid-murid SD Islam Al Azhar 40 Cilegon.
Hal ini sesuai dengan tajuk "Akhlakul Karimah" yang selama ini menjadi representasi identitas dari Yayasan Pendidikan Krakatau Steel. Khatam Qur'an tersebut tidak hanya sebagai simbolis program sekolah, tetapi lebih dari itu menjadi pedoman yang harus diamalkan setiap hari.